超声波细胞粉碎机在基因测序中的应用
一、超声波细胞粉碎机在基因测序中的应用
随着技术的发展,遗传信息及其表达调控的研究手段越来越多,高通量测序技术是其中最有效的手段之一。目前,利用高通量测序手段研究生物遗传信息和基因表达调控信息已相当普及。然而,测序前需要先制备适当大小DNA片段的样本文库。因此,测序前需要对基因组DNA进行破碎,使其片段长度满足测序要求。RNA-seq对测序片段的长度要求也和DNA高通量测序的一样。目前三大主流测序平台的平均测序读长基本在100~400bp范围内。其中Illumina测序平台更是主流中的主流,其测序片段的读长是150bp×2,其双端测序需要的样本DNA片段长度为300bp左右。片段太长或太短,都不能经济有效地实现高通量测序过程。如片段太长,会在固定DNA到固体基质上时的效率低下且影响后续的测序效果、降低测序量。如果片段太短,则会导致测序读长偏短、增加测序成本和后续拼接的工作量。因此,测序前首先要获得高质量的核酸片段。
二、超声波细胞粉碎机的使用
超声波细胞粉碎机进行破碎前,需将样品溶解在溶液中,然后通过探头对样品进行超声破碎
三、超声波细胞粉碎机的应用
仪器被广泛应用于生物学、微生物学、物理学、动物学、农学、制药、石油等领域的教学、科研、生产。适合单个样品量少,样本数多实验的好帮手,例如细胞破碎,裂解;抽提蛋白、核酸;修剪DNA/RNA;.纳米技术研究,纳米材料的分散;.染色质免疫沉淀技术;样品均质、乳化;加速溶解,加速化学反应等其它样品处理。